少林寺禅宗医学源远流长，甚至有几千年的历史，涌现出许多著名的僧人医生

少林禅医药，至少要追溯到建寺之初。由于少林寺的皇家寺院地位，拥有良田百顷，殿宇上百间，众僧整天参禅静坐，修身养性，驱除杂念，消除思乱，镇静魂魄，安定心神。但长期静坐不动，影响了禅师周身血液循环，造成筋络不畅，久瘀成疾。不仅影响了身体，还难以对付山林中的猛兽威胁和盗贼侵犯。于是，禅师们在学禅的同时开始习武，并充分利用嵩山丰富的药材资源，吸收民间医疗方法，不断积累用药经验，逐步形成了许多秘方。

禅师们在练武的同时，发现许多功法具有健身和医疗的双重作用，又逐步推演出了气功疗法，推拿疗法和点穴疗法。少林医学由外科而内科，由治疗跌打损伤而治疗百病，形成了独具特色的少林禅医药文化。据《少林武僧志》记载，僧稠禅师曾经取嵩参熬汤为跋陀补养身体。跋陀的另一位徒弟慧光，也曾用铁针为一昏迷病人疗伤。特别是西天佛祖第二十八代法脉传人一达摩祖师至嵩山少林寺后，传授面壁默照禅法，确定禅宗祖庭地位并兼授佛教“五明”。

历代高僧在精修禅法的同时，而学“医方明”更受重视，禅宗二祖慧可断臂求法后在钵盂峰上养伤，寺僧们采来草药为他治疗。代代相传，生生不息，有言传，有秘传。历史上，少林寺涌现了大批知名僧医。北魏后期的少林高僧洪遵和志刚被尊为活菩萨，分别撰有《少林寺针灸秘抄》和《少林医僧宝囊》。隋代，少林僧人子升善武好医，尤其对气功和点穴治疗的内容，特别详细地介绍了人体常用的六十八穴的部位、取法、疗法及配方，开列了一百多种常见病的点穴治疗指要。

十三棍僧救唐王中的寺主僧志操也是一位著名的僧医，人寺前习医十年，治疗跌打损伤，总是先用针灸，少数不息者再采用满山上的草药制成的丸、丹青等治疗，并著有《少室僧针灸秘经集》等。唐初末年的福湖和尚医技高明，善用针灸和草药。扎针不过二，用药不过三，特别对止血、内瘀、厥症、危症等的治疗有独绝之处，撰有《少林伤科十大方》。宋代的洪温禅师擅长骨伤科，多以针刺加火罐解除患者痛苦，撰有《针后拔罐秘法》，临终前将技艺给觉远和尚。

觉远和尚对内科深有研究，有《少林寺内科神效录》传世。元代的惠定被尊为少林神医，著有《少林骨科旨要》、《少林医家丸散药谱》，惠炬在《针刺九十神穴》中总结了元以前僧医大师的经验，是针灸用穴的临床精华。明代著名的僧医有本明、幻休、正道等，清代随着武术的衰落，医技有所下降，较为著名的有湛举、寂勤、贞俊等。

公元1217年，东林志隆出任少林寺住持，创建了少林药局，以少林医方服务本寺僧众及百姓，享有盛誉，被称为“佛门医宗”。